Frankie wird in ein Krankenhaus einliefern, aber die Ärzte finden keine medizinische Erklärung für die Geschehnisse; sie halten es zunächst für einen missglückten Selbstmordversuch. Als Frankie in der U-Bahn Opfer eines Attacke dieser fremden Mächte wird, ist auch ein Priester anwesend. Der schickt das Überwachungsband aus der Videokamera der U-Bahn an Kardinal Houseman (
Jonathan Pryce) im Vatikan, der Pater Kiernan mit weiteren Nachforschungen beauftragt. Er besucht Frankie, die nicht an Gott glaubt, und versucht mit ihr eine Erklärung für die unheimlichen Vorgänge zu finden. Jedoch zunächst ohne Erfolg. Kiernan will bereits wieder nach Rom zurückreisen, als er eine erste Spur findet...
Gewisse Parallelen zum Klassiker "Der Exorzist" sind verkennbar. Aber da, wo Friedkin im Exorzisten versucht, eine düstere, bedrohliche Spannung aufzubauen, nimmt Rupert Wainwright "Stigmata" einen Großteil der Atmosphäre durch hektische Schnitte im Video-Clip-Rhythmus. Da mag die Besetzung von Gabriel Byrne eine gute Idee gewesen sein und Patricia Arquette das passende Gegenstück - zum Tragen kommen sie leider beide nicht.